Первый век нашей эры. Юная девушка покидает свою маленькую рыболовную деревушку и семью, преисполненную традиций, чтобы присоединится к совершенно новому социальному движению. Родные её абсолютно не понимают, считая, что она позорит их род и в неё вселился бес. Лидером этого движения является харизматичный мужчина по имени Иисус из Назарета, который обещает, что мир измениться. Мария же ищет новый жизненный путь для себя. Многие уже знают о группе Иисуса, и власть Римской империи абсолютно не одобряет их деятельность. Как многим известно, путь Иисуса сложился весьма трагично, но ещё
Каллум Линч приговорён к смертной казни. Внезапно его спасает странная компания, которая говорит, что он – предок члена давнего Ордена Ассасинов Агилара, который жил в XV веке в Испании. Для того, чтобы из Каллума вытянуть воспоминания испанца, его помещают в сверхновый аппарат под названием "Анимус". Таким образом главный герой становится своим предком и проживает времена испанской инквизиции. После длительного пребывания в "Анимусе" у Линча появляется "эффект Просачивания" – дает человеку умения его предка. Каллум продолжает дело Агилара и борется против ордена Тамплиеров, но уже в наши дни.
1947 год. Венгерский архитектор Ласло Тот и его супруга Эржебет переезжают из послевоенной Европы в США. Там их жизнь стремительно меняется после знакомства с загадочным клиентом.