Конг и его защитники отправляются в опасное путешествие на поиски своего настоящего дома. К ним присоединяется осиротела девочка Цзя, которая имеет уникальную и сильную связь с Конгом. Однако неожиданно на своем пути они встречают разъяренного монстра Годзиллу, что несет разрушения везде, где ступит его нога. Эпическое столкновение двух титанов, спровоцированное невиданными силами, - это только ключ к разгадке тайны, спрятанной в самом ядре Земли.
Через два года после нападения на Сидней, инопланетяне продолжили добивать выживших. Они в отчаянном последнем рывке попытались отбить столицу Австралии, но потерпели поражение, захватив при этом важные разводные данные: инопланетяне ищут «проект« Дождь ». Бравый солдат Симмонс и его друг-пришелец Гарри отправляются на поиски таинственного «Дождя», пока Амелия снова пытается примирить между собой враждующие стороны.